RNDr. Alica Chroňáková, Ph.D.

Funkce: Vědecký pracovník - Oddělení půdní mikrobiologie a půdní chemie , Člen rady - Vědecká rada ÚPB

Kontaktní údaje

Telefon: 420387775770; 420387775779; 420387775762
E-mail: alicach@upb.cas.cz
Místnost: NB209

Popis

RNDr. Alica Chroňáková, Ph.D.

Funkce: Vědecký pracovník

 

Telefon: +420 387775770 (5762)

E-mail: alica.chronakova@upb.cas.cz

Místnost: NB209

 

Osobní údaje:

* 1972, Trenčín, Slovakia

 

Adresa: Hůrka 24, 397 01 Písek

 

Afiliace a adresa zaměstnavatele: Biologické centrum AV ČR, v. v. i., Ústav půdní biologie, Na Sádkách 7, 370 05 České Budějovice, Česká republika,

Phone/Fax: +420 387775770, E-mail: alica.chronakova@upb.cas.cz

 

Pracovní zařazení, funkce: Vědecký pracovník

 

Vzdělání:

Ph.D. ekologie, Jihočeská Univerzita v Českých Budějovicích, Přírodovědecká fakulta, České Budějovice a Ústav půdní biologie AV ČR (2009). Supervisor: Ing. Václav Krištůfek, CSc.

RNDr. mikrobiologie, Jihočeská Univerzita v Českých Budějovicích, Přírodovědecká fakulta, České Budějovice a Ústav půdní biologie AV ČR (2009). Supervisor: Ing. Václav Krištůfek, CSc.

MSc. mikrobiologie a molekulární biologie, Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Praha (1995). Supervisor: doc. Jitka Forstová, CSc.

BSc. biologie, Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Praha (1993).

 

Specializace: Ekologie půdních mikroorganizmů (bakterie, aktinomycety a archaea), molekulární mikrobiální ekologie, člověkem narušené a podzemní terestrické ekosystémy, next-generation sequencing, vyhledávání biologicky aktivních látek.

 

Odborná praxe:

2002 - dosud Biologické centrum AV ČR, v. v. i., Ústav půdní biologie

 

Výuka:

KBE017, garant kurzu, Molekulární metody v ekologii půdy a vody, Přírodovědecká fakulta Jihočeské Univerzity v Českých Budějovicích

KBE020, část kurzu, Ekologie půdních mikroorganizmů, Přírodovědecká fakulta Jihočeské Univerzity v Českých Budějovicích

KBO121, část kurzu, Praktika 454 pyrosekvenování, Přírodovědecká fakulta Jihočeské Univerzity v Českých Budějovicích

 

Členství

2016 - dosud Ústav půdní biologie – vědecká rada

2016 - dosud Česká společnost pro ekologii (ČSPE)

2016 - dosud Československá společnost mikrobiologická (ČSSM) 

 

Organizace konferencí

2011, Ecology of Soil Microorganisms, 27.4. – 1.5. 2011, Praha, editace sborníku abstraktů

 

Další zkušenosti

2016 – kurátor sbírky půdních aktinomycetů, v rámci BCCO (Biology Centre Collection of Organisms). www.actinomycetes.cz

 

Publikace
Celkem nalezeno: 33 záznamů
Kyselková M., Chrudimský T., Husník F., Chroňáková A., Heuer H., Smalla K., Elhottová D. (2016) Characterization of tet(Y)-carrying LowGC plasmids exogenously captured from cow manure at a conventional dairy farm FEMS Microbiology Ecology 92: fiw075.
DOI: 10.1093/femsec/fiw075
Petříček M., Petříčková K., Pospíšil S., Kuzma M., Chroňáková A., Krištůfek V., Stříž I. (2016) Manumycin-type metabolite called Colabomycin E which inhibits caspase 1 and creation of interleukins, strain produces the Colabomycin E and a method of a production of the Colabomycin E Vlastník: Biologické centrum AV ČR, v. v. i.- Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.- Institut klinické a experimentální medicíny. Datum udělení patentu: 20.09.2016. Číslo patentu: US9447062
Sinclair L., Ijaz U.Z., Jensen L.J., Coolen M.J.L., Gubry-Rangin C., Chroňáková A., Oulas A., Pavloudi Ch., Schnetzer J., Weimann A., Ijaz A., Eiler A., Quince Ch., Pafilis E. (2016) Seqenv: Linking sequences to environments through text mining PeerJ 4: DOI: 10.7717/peerj.2690
Chroňáková A., Schloter-Hai B., Radl V., Endesfelder D., Quince C., Elhottová D., Šimek M., Schloter M. (2015) Response of archaeal and bacterial soil communities to changes associated with outdoor cattle overwintering PLoS ONE 10: -.
DOI: 10.1371/journal.pone.0135627
Koubová A., Chroňáková A., Pižl V., Sánchez-Monedero M.A., Elhottová D. (2015) The effects of earthworms Eisenia spp on microbial community are habitat dependent European Journal of Soil Biology 68: 42-55.
DOI: 10.1016/j.ejsobi.2015.03.004
Kyselková M., Kotrbová L., Bhumibhamon G., Chroňáková A., Jirout J., Vrchotová N., Schmitt H., Elhottová D. (2015) Tetracycline resistance genes persist in soil amended with cattle feces independently from chlortetracycline selection pressure Soil Biology and Biochemistry 81: 259-265.
Petříčková K., Chroňáková A., Zelenka T., Chrudimský T., Pospíšil S., Petříček M., Krištůfek V. (2015) Evolution of cyclizing 5-aminolevulinate synthases in the biosynthesis of actinomycete secondary metabolites: Outcomes for genetic screening techniques Frontiers in Microbiology 6: -.
DOI: 10.3389/fmicb.2015.00814
Řeháková K., Chroňáková A., Krištůfek V., Kuchtová B., Janatková K., Scharfen J., Čapek P., Doležal J. (2015) Bacterial community of cushion plant thylacospermum ceaspitosum on elevational gradient in the himalayan cold desert Frontiers in Microbiology 6: -.
DOI: 10.3389/fmicb.2015.00304
Mulec J., Krištůfek V., Chroňáková A., Oarga A., Scharfen J., Šestauberová M. (2014) Microbiology of Healing Mud (Fango) from Roman Thermae Aquae Iasae Archaeological Site (Varaždinske Toplice, Croatia) Microbial Ecology 69: 293-306.
DOI: 10.1007/s00248-014-0491-5
Petříčková K., Pospíšil S., Kuzma M., Tylová T., Jágr M., Tomek P., Chroňáková A., Brabcová E., Anděra L., Krištůfek V. (2014) Biosynthesis of colabomycin E, a new manumycin-family metabolite, involves an unusual chain-length factor ChemBioChem 15: 1334-1345.
Radl V., Chroňáková A., Čuhel J., Šimek M., Elhottová D., Welzl G., Schloter M. (2014) Bacteria dominate ammonia oxidation in soils used for outdoor cattle overwintering Applied Soil Ecology 77: 68-71.
Šimek M., Virtanen S., Simojoki A., Chroňáková A., Elhottová D., Krištůfek V., Yli-Halla M. (2014) The microbial communities and potential greenhouse gas production in boreal acid sulphate, non-acid sulphate, and reedy sulphidic soils Science of the Total Environment 466-467: 663-672.
Šustr V., Chroňáková A., Semanová S., Tajovský K., Šimek M. (2014) Methane production and methanogenic archaea in the digestive tracts of millipedes (Diplopoda) PLoS ONE 9: -.
Chroňáková A., Ascher J., Jirout J., Ceccherini M.T., Elhottová D., Pietramellara G., Šimek M. (2013) Cattle impact on composition of archaeal, bacterial, and fungal communities by comparative fingerprinting of total and extracellular DNA Biology and Fertility of Soils 49: 351-361.
Frouz J., Livečková M., Albrechtová J., Chroňáková A., Cajthaml T., Pižl V., Háněl L., Starý J., Baldrián P., Lhotáková Z. (2013) Is the effect of trees on soil properties mediated by soil fauna? A case study from post-mining sites Forest Ecology and Management 309: 87-95.
Kyselková M., Jirout J., Chroňáková A., Vrchotová N., Bradley R., Schmitt H., Elhottová D. (2013) Cow excrements enhance the occurrence of tetracycline resistance genes in soil regardless of their oxytetracycline content Chemosphere 93: 2413-2418.
Bannert A., Bogen C., Esperschütz J., Koubová A., Buegger F., Fischer D., Radl V., Fu R., Chroňáková A., Elhottová D. (2012) Anaerobic oxidation of methane in grassland soils used for cattle husbandry Biogeosciences 9: 3891-3899.
DOI: 10.5194/bg-9-3891-2012
Bradley R.L., Chroňáková A., Elhottová D., Šimek M. (2012) Interactions between land-use history and earthworms control gross rates of soil methane production in an overwintering pasture Soil Biology and Biochemistry 53: 64-71.
DOI: 10.1016/j.soilbio.2012.04.025
Koubová A., Goberna M., Šimek M., Chroňáková A., Pižl V., Insam H., Elhottová D. (2012) Effects of the earthworm Eisenia andrei on methanogens in a cattle-impacted soil: A microcosm study European Journal of Soil Biology 48: 32-40.
DOI: 10.1016/j.ejsobi.2011.09.007
Kyselková M., Chroňáková A., Volná L., Němec J., Ulmann V., Scharfen J., Elhottová D. (2012) Tetracycline resistance and presence of tetracycline resistance determinants tet(V) and tap in rapidly growing mycobacteria from agricultural soils and clinical isolates Microbes and Environments 27: 413-422.
DOI: 10.1264/jsme2.ME12028

Více publikací

KONTAKT

Biologické centrum AV ČR, v.v.i.
Ústav půdní biologie
Na Sádkách 702/7
370 05 České Budějovice

NAJÍT PRACOVNÍKA